Перевести страницу


EMBL to PDB Converter

2D & 3D Genetic code


2017          2018          2020            2 0 2 3



Music of a Proteine



Read the monograph

 


tttttt


 




Ограничения метода РСА



РСА : Что мы видим?



2017.04.05    09:13:19

Пикотехнология белков, ДНК, РНК

Татьяна Рясина пишет:

Как кратко пояснить, зачем нужен сайт с готовыми моделями? 

Люди вообще слышат и видят в первый раз в жизни.

Кушелев:

Ежедневно на нашей планете кто-то оплачивает не менее 30 заказов по структурам белковых молекул. Это видно по увеличению количества белков в Protein Data Base (PDB). За каждую структуру платят в среднем 10 000 евро и ждут от нескольких недель до нескольких лет.

Структуры нужны фармацевтам, биотехнологам, генным инженерам. Потенциальных заказчиков можно найти по ключевым словам protein, nanotech



РСА (ЧЕРЕЗ ПОИСК ФОРУМА ЛАБОРАТОРИИ НАНОМИР)

Рентгенограммы РСА 2016.12.16 02:27:47

Результаты анализа рентгенограмм РСА 2016.12.16 02:37:23

97% белков не кристаллизуеся. Системные ошибки РСА 2016.12.16 02:45:32

РСА может показать чего нет и не показать что есть  2016.12.26 23:36:22

РСА цены 2016.12.21 21:15:50  ,  2016.12.21 20:07:17 , 2016.12.21 20:07:17

Точность РСА 2016.12.21 17:59:55  ,  2016.12.15 22:00:22 ,  2016.12.15 22:00:44 ,   2016.12.14 12:38:03  ,  2016.12.21 14:31:08

Корреляция данных РСА с Пикотех  2016.12.18 14:41:58

РСА стремится к Пикотех 2016.12.19 15:18:09

Лауэграммы и ренгенограммы 2016.12.14 17:40:20 , 2016.12.14 18:21:50 

Молекула лизоцима 2016.12.14 20:27:43




2016.12.21 21:05:30

http://www.vokrugsveta.ru/telegraph/theory/1071/

https://img-fotki.yandex.ru/get/194492/158289418.3a7/0_16df1f_9732efdb_XL.jpg
Цитата: Фотоотчет о выращивании белковых кристаллов на МКС во время 12-й экспедиции с 1 октября 2005 по 8 апреля 2006 года. Рост одного кристалла занимал 25 дней. Фото: NASA


2016.12.21 21:15:50

[20:05:27] Кушелев Александр Юрьевич: 500 000 / 120 = 4167 USD за один кристалл белка. Добавьте сюда сопутствующие работы, например, собственно РСА и анализ данных.
[21:04:47] Кушелев Александр Юрьевич: Вам эти фразы должны понравиться:


https://img-fotki.yandex.ru/get/61266/158289418.3a7/0_16df20_8cf98a5a_XL.jpg


"из невразумительных точек и кругов с помощью специальных математических преобразований получают информацию о расположении атомов. Для неспециалистов выглядят как шарлатанство. Даже если решетка несложной формы, эта задача непростая, но все честно." Подробнее: http://www.vokrugsveta.ru/telegraph/theory/1071/
[21:09:54] Кушелев Александр Юрьевич: При большом везении при переборе 600 условий кристаллизации найдется 1–2 раствора, в которых появятся кристаллы. Как правило, на первом этапе они небольшие, непрозрачные и совершенно неправильной формы, то есть не подходящие для рентгеноструктурного анализа.
[21:15:41] Кушелев Александр Юрьевич: Вот ещё цитата о цене белкового кристалла:  На получение одного кристалла белка ученые могут потратить десятки тысяч евро, а фармацевтические компании готовы заплатить еще большие деньги за подробную информацию о структуре какого-нибудь важного для медицины белка — «замка», к которому можно подбирать «отмычку» — лекарство.


2016.12.21 20:07:17

[19:54:52] Кушелев Александр Юрьевич: Например, узнайте цену структуры белка, кристалл которого нужно выращивать 2 года 
[19:55:12] Andrei: речь не обо мне а о вас, знаете ли вы цену или просто придумываете 
[19:59:00] Кушелев Александр Юрьевич: Мне сказали цену специалисты из лаборатории РСА
[19:59:15] Кушелев Александр Юрьевич: Кстати, почитайте ещё раз, как проводится анализ: http://bio.1september.ru/view_article.php?ID=200900401
[20:00:25] Andrei: Сказать это одно, а заказать другое:)
[20:01:35] Кушелев Александр Юрьевич: Вот сюда позвоните и спросите, сколько будет стоить кристаллизация белка (минимум и максимум): http://www.piboc.dvo.ru/structure/ext_l … ristal.php
[20:03:14] Andrei: Ладно, это мелочь
[20:03:31] Andrei: Надо искать кому это нужно и зачем
[20:03:46] Кушелев Александр Юрьевич: Вот Вам конкретные данные:  "со ста двадцатью образцами работа еще даже не начиналась. На их восстановление потребуется не меньше полумиллиона долларов и от нескольких недель до нескольких месяцев работы." Подробнее: http://www.vokrugsveta.ru/telegraph/theory/1071/
[20:04:08] Кушелев Александр Юрьевич: 120 кристаллов белка - 500 000 долл.
[20:05:27] Кушелев Александр Юрьевич: 500 000 / 120 = 4167 USD за один кристалл белка. Добавьте сюда сопутствующие работы, например, собственно РСА и анализ данных.