Перевести страницу


EMBL to PDB Converter

3D Genetic code


       2018           2020            2024



Music of a Proteine



Read the monograph

 


tttttt


 




2D диаграммы трехмерной формы белков



Шедевры белковой архтектуры


Высоко периодичные структуры белков

РСА : что мы видим?


ПРОГРАММИРУЕМ ДЕКОДЕР кода белка в 3D структуру


Алгоритмы


КРАТКАЯ  2D диаграмма ПИКОТЕХ

Красный - альфа-спираль.
Оранжевый - 310-спираль.

Синий - пи-спираль.
Розовый - одиночный код альфа/310 спиралей.
Бирюзовый - одиночный код  пи-спирали.
Тёмно-зеленый - бета-спираль.

Зелёный - одиночный код бета-спирали
Сиреневый - метиониновая спираль. У неё более крупный шаг "резьбы", чем у обычной альфа-спирали.

Жёлтый - сустав пролина
Черный в сокращённом представлении и белый в развернутом означают либо неизвестный код, либо конец трансляции.
Циклическое повторение цветов (композиционных кодов) - программная спираль.


Программные спирали - повторение последовательности композиций. Например, один код альфа-спирали, затем один код пи-спирали. n(35) задаёт программную спираль, а n3 или n5 - простые спирали (пи-спираль и альфа-310-спираль).
232323 - программная n(23)-спираль
141414 - программная n(14)-спираль






Шедевры белковой архтектуры


Высоко периодичные структуры белков


РСА : что мы видим?


2D диаграммы Пикотехнологии - 

способ показать точную  пространственную 3D структуру, закодированную кодом белка.



0001-KAE8283720-1-P-0-b1

 Фрактальная 585557-спираль с периодом 6.


 

0002-KAI4874617-1-P-0-b1

 Фрактальная 1114477-спираль с периодом 7.


 0003-KAH3791119-1-P-0-b1

 Маленький белок с длинной альфа-спиралью (красный).



0003-RUS81114-1-P-0-b1


Переходы фрактальных спиралей разных типов.




0004-CAD7264879-1-P-0-b1

 Фрактальная 33333555755887775-спираль с периодом 17



0005-KAI8742171-1-P-0-b1

 Фрактальная 8755755877P-спираль с периодом 11.


0045-KAI8742211-1-P-0-b1

Этот маленький белок состоит из нескольких периодов фрактальной спирали, состоящей из альфа-спиральных участков (красный), 310-спиральных участков (оранжевый) и пи-спиральных участков (синий).


 

0047-KAF7637509-1-P-0-b1

 Фрактальная 3333333P77P77P77875-спираль с периодом 19.

 


0008-KAE8283727-1-P-0-b1

 Фрактальная квази-спираль с типовым периодом 7.


 

0012-CAG2238035-1-P-0-b1

 Фрактальная 33333335587877558-спираль с периодом 17.


 

0015-KAF6208734-1-P-0-b1

 Фрактальная квазиспираль с типовым периодом 19.


 

0087-KAI8742253-1-P-0-b1

Фрактальная спираль с дробным периодом (~14.7) переходит в 411617P75755577-спираль с периодом 15.


 

0110-KAE8283829-1-P-0-b1

 Фазированный фрактал (квази-спираль)


0174-KAF6208890-1-P-0-b1

 Фрактальная 3333311114885575-спираль с периодом 16.


 

0349-KAE8621205-1-P-0-b1

 Фрактальная спираль с периодом 32.


0404-KAI8742570-1-P-0-b1

 Фрактальная спираль с периодом 21.



0528-KAI8742694-1-P-0-b1

 Фрактальная 111181111757575577-спираль с периодом 18.


 

0505-KAE8621361-1-P-0-b1

 Фрактальная спираль с периодом 29.


 

1184-KAE8622042-1-P-0-b1

 Фрактальная спираль с периодом 76.


0133-KAH3791249-1-P-0-b1

Фрактальная Q-спираль (75-спираль Кушелева) переходит в бета-спираль (L-спираль).

 

0208-KAF6208924-1-P-0-b1

 Фрактальная квазиспираль в стиле куфи.





0002-KAI8767515-1-P-0-b1

 Фрактальная 5557555P75577-спираль с периодом 13.



0015-KAF6208734-1-P-0-b1

 Фрактальная квазиспираль с типовым периодом 19.